一、疫情性質與死亡率
- 所有流感病毒共有八條基因，新型流感的八條基因有二條來自歐美豬隻的流感病毒，二條來自亞洲豬隻的流感病毒，二條來自禽類的流感病毒，二條來自人類的流感病毒，因此這樣的流感病毒是前所未見的病毒，所以全世界六十一億人口都可能感染。世界衛生組織認定這樣的病毒將對人類造成嚴重的衝擊。
- 在四月份時，墨西哥發生新流感的暴發，導致五百多人喪命，死亡率高達百分之八，這樣的情形與SARS類似。此外，墨西哥有大量的西班牙裔人口移入，紐約及加拿大亦有同樣的情況，然而新流感的暴發紐約卻未相對嚴重，因此專家開始思考，新流感的死亡率到底有多高?根據全球性的統計調查，新型流感的死亡率預估是千分之四，最高可以到千分之八。
二、及早用藥的重要性
- 紐約市今年新型流感致死率高達百分之二，威斯康辛州今年新型流感致死率則是千分之二，其差別在於「得病後用藥的時機」。紐約市長擔心新流感的擴散導致人民的恐慌，所以許多新流感病患皆是等到重症時才予以治療，而威斯康辛州州長卻在感染時就予以治療，這樣的現象，導致紐約新型流感的致死率遠遠高於威斯康辛州新型流感的致死率。從美國的例子中發現，感染後儘速用藥，死亡率低；重症才用藥，死亡率較高。
- 新型流感病毒在進入人體後，發病初期的前兩天病狀其實相當輕微，然而隨著病毒在人體不斷的複製，當複製數相當高的時候，而此時人體的免疫力卻過強，將造成人體免疫系統的風暴，並促使人體的器官衰竭，進而導致死亡，從發病到重症的時間約有十天。在墨西哥的例子中，大部份年輕人平常要去上班，一旦病毒爆發且未即時用藥治療，此時病毒促使人體器官衰竭，就算緊急施用克流感，克流感也無法壓制病毒的擴散。
- 新型流感和SARS感染上的差別，在於新型流感不必等到發燒就會傳染，而SARS則是需發燒後病毒才會傳染，因此，台灣在新流感爆發初期，專家學者即呼籲政府應儘早儲備克流感及疫苗，因為早期的治療與控制相當重要。
三、藥劑準備不足將導致難以及早用藥
- 現今台灣克流感的藥劑乃是從當初民進黨執政時，防範禽流感爆發所儲備的藥劑，2008年迄今我國尚未再購買任何克流感的藥劑。官方雖然說目前流感用藥準備可滿足18%人口所需，但這個比例並不夠，而且其中第一線用藥「克流感」僅有200萬份，約9%人口所需，另100萬份「瑞樂莎」是第二線用藥，是在克流感產生抗藥性時使用的，其他的僅是原料，不是真的用藥。
- 防疫的理想作法，是「病在哪裡，醫在哪裡」，在社區就杜絕感染；因為如果把問題都延後並丟給大醫院，最後必然會癱瘓醫療體系，交叉感染的機會也大增。現在的病患尚可接受好的照顧，但大流行後，醫生和醫院的負荷量一定會難以承受地重，在第一線阻絕是絕對必要的。
- 一旦新流感爆發，地方醫療機構或診所必須要儘早投藥治療。但在台灣，目前政府大部份的克流感藥劑多儲備於指定的醫學中心，實際上藥劑的儲備量也不足，將使地區診所面臨無藥可用之窘境，無法早期治療，死亡率與傳染率的風險也將提高。因此目前急需克流感的佈建。
- 台灣應該效法威斯康辛州對於新流感的防制措施，縣市的藥劑準備量至少要有人口的10%，民進黨應優先呼籲南部各縣市地方政府首長，盡速要求全國克流感藥劑下放至各地區的醫療機構及社區醫療診所，及早用藥，並強化校園感染與傳染的抑制；學校如果沒有校醫，最好有社區醫生進駐。
四、疫苗的準備不足及不確定性
- 今年四月初，專家學者呼籲政府應儘速儲備疫苗，瑞士的藥廠在六月時也詢問台灣是否需要採購。但政府卻堅持以國光生技公司發展為考量，採用最低標的採購模式，導致外國廠商不願投標，因此喪失向國際藥廠採購疫苗的黃金時間。同時間，世界各國到處搶購新流感防治藥劑及疫苗。現在疫苗與藥劑已經是賣方市場，有錢也未必買得到，台灣如今就算很想向國際四大藥廠購買防制克流感的藥劑及疫苗，都難達成。
- 針對我國欲向國際四大藥廠採購新流感疫苗的部份，採購決策權乃屬行政院衛生署署長的職責，然而對於新流感所帶來損害的認知不足，以及對於專業知識的判斷錯誤，台灣新流感的爆發將勢在必行。衛生署的保守採購政策，也可能與行政院不願核給疾管局更多預算有關。
- 台灣的防疫疫苗準備，完全指望國光的生產，但目前國光疫苗尚未通過人體試驗及臨床測試，疫苗有效性並不確定（最壞的可能是無效）；加上疫苗研發恐有其他副作用，影響人民施打意願。
- 依照目前趨勢，國光疫苗11月時才出來，但到時很可能全台已有一半人口感染。在這之前，只能期待靠用藥及其他防疫措施控制疫情。
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